Juin 1940. A l'heure de la débâcle, Jean Moulin, Préfet de Chartres, s'efforce de rassurer la population. Mais lorsque les allemands arrivent, il lui faut se mettre à leur disposition, et c'est pour ne pas trahir ses convictions qu'il est torturé, jeté en prison et qu'il se tranche la gorge. Sauvé, il reprend ses fonctions pour quelques mois, puis est... finalement renvoyé par l'administration pétainiste. Il gagne Paris, réactive ses réseaux politiques, parcourt le pays pour établir un état des lieux de la résistance en formation. Il revoit aussi Gilberte, la femme de sa vie. En octobre 1941, Jean Moulin s'embarque pour Londres.